Le village est situé dans la partie supérieure de la val Bormida, avec le peuplement urbain situé le long de la rive droite de la rivière Bormida, qui dans cette section prend la dénomination de Bormida de Millesimo. Le territoire fait partie du Parc Naturel Régional du Bric Tana.
A Millesimo, il est présent et préservé un site d’intérêt communautaire, proposé par le réseau Natura 2000 de la Ligurie, pour son intérêt naturel, de faune et géologique. Le site est situé dans la région boisée de Bric Tana et Bric Mongarda où il y a des grottes où des vestiges préhistoriques ont été trouvés.